Des chercheurs chinois citent des indices selon lesquels les chats et les chiens peuvent transmettre le COVID-19 – Bien choisir son serveur d impression

Depuis que le monde a pris conscience de l'infection respiratoire connue sous le nom COVID-19[feminine en décembre, une certaine attention s'est concentrée sur la façon dont tout a commencé. L'une des principales hypothèses est la propagation de la maladie à partir d'animaux vendus sur un marché d'animaux vivants dans la capitale de la province du Hubei, à Wuhan, en Chine. Parmi les coupables possibles se trouve le mangeur de fourmis en voie de disparition du sud-est asiatique connu sous le nom de pangolin.

Cependant, rien de tout cela n'est certain; George Gao, directeur général du Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies, a déclaré Magazine scientifiqueC'est Jon Cohen la semaine dernière qu'il est possible que le marché ne soit qu'un arrêt en cours de route, pas l'origine. "Maintenant, je pense que le marché pourrait être le lieu initial, ou ce pourrait être un endroit où le virus a été amplifié", a déclaré Gao à Cohen. "C'est donc une question scientifique. Il y a deux possibilités."

Sans répondre à la question de savoir comment tout a commencé, un nouveau travail de recherche cette semaine suggère que beaucoup de mammifères, pas seulement les pangolins, pourraient jouer un rôle – y compris les chats et les chiens.

Dans un article publié sur le serveur préimprimé bioRxiv, intitulé Atlas de l'expression des gènes ACE2 chez les mammifères, révèle de nouvelles perspectives sur la transmission du SRAS-Cov-2, les auteurs Kun Sun, Liuqi Gu, Li Ma et Yunfeng Duan, qui sont affiliés avec le laboratoire de Shenzhen Bay à Shenzhen et l'Académie de biotechnologie Huayuan de Pékin à Pékin, décrivent avoir effectué une analyse comparative des "schémas d'expression" de certains gènes dans la biologie des mammifères.

Les Centers for Disease Control des États-Unis ont déclaré ne pas disposer de preuves que "les animaux de compagnie, y compris les animaux de compagnie, peuvent propager le COVID-19". Le CDC dispose d'un vaste ensemble de documents sur les animaux de compagnie et la maladie et comment rester en sécurité.

Malgré cette affirmation du CDC, les chercheurs chinois pensent avoir trouvé des preuves génétiques reliant les chats, les chiens et une foule d'autres mammifères à la maladie. "Nos analyses suggèrent une forte possibilité que les chats et les chiens puissent héberger le SRAS-CoV-2", écrivent-ils. Ils vont plus loin, spéculant qu '"il est probable que les chats et les chiens peuvent avoir contribué à la pandémie de COVID-19".

Comme le document est publié sur un serveur de préimpression, il n'a pas encore été vérifié par des pairs, il convient donc d'être plus prudent quant à l'acceptation des conclusions du document, car il n'a pas encore été soumis à la quantité habituelle de examen minutieux de la recherche scientifique.

Pour effectuer leur travail de détective, les auteurs ont commencé avec quelque chose appelé l'ACE2, l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2. C'est une protéine à la surface des cellules qui serait le virus à l'origine du COVID-19, du coronavirus ou du SRAS. -CoV-2, s'attache aux cellules pour les infecter – son récepteur, comme on l'appelle. Une recherche intense est en cours pour comprendre la connexion.

Les auteurs ont recherché la prévalence de cette protéine chez d'autres animaux par rapport à l'homme. Ils notent ce qu'ils considèrent comme un «niveau élevé» d'expression de la protéine chez les chats et les chiens et autres, et ils concluent que ces espèces ont «des tissus sensibles à l'infection par le SRAS-CoV-2».

Pour étudier cela, ils ont parcouru les bases de données du transcriptome – la totalité de l'ARN messager dans le corps – de diverses espèces. L'ARN messager est les molécules d'acide nucléique qui fournissent les instructions de l'ADN aux usines de fabrication de protéines de la cellule. C'est un indice, en d'autres termes, sur ce qui se construit dans le corps et dans quelle mesure. Les bases de données qu'ils ont consultées, rassemblées au fil des ans par de nombreux chercheurs, couvrent les humains et les chauves-souris et les pangolins, ainsi que les chats, les chiens, les hamsters, les porcs, les chèvres et quelques autres espèces.

Ils ont utilisé des outils logiciels pour effectuer une analyse des enregistrements d'ARN à travers les espèces – en particulier, Ktrim, un programme pour nettoyer les données qui sont distribuées sur Github); et un autre package open-source appelé STAR qui est utilisé pour aligner les sections d'ARN afin que l'on puisse en comprendre le sens.

Cette comparaison des séquences d'ARN conduit les auteurs à conclure que «les gènes ACE2 de mammifère sont hautement conservés à travers les lignées et présentent de larges profils d'expression», ce qui signifie que la protéine est répandue chez de nombreux mammifères. "Plus particulièrement, nos analyses ont révélé que les niveaux d'expression de l'ACE2 sont particulièrement élevés chez les chats et les chiens", écrivent-ils. "Surtout chez les chats, les niveaux d'expression dans les quatre principaux tissus du hotspot d'expression ACE2 sont tous de magnitudes plus élevés que tous les autres mammifères examinés."

Les auteurs notent que la peau et les oreilles des chats et des chiens ont des niveaux élevés d'expression de la protéine ACE2. Cela les amène à conclure: "Ces parties extérieures du corps les rendent particulièrement susceptibles d'héberger le SRAS-CoV-2 et de se transmettre aux humains par contact cutané".

Une question qui nécessite un examen plus approfondi est de savoir si le simple fait d'avoir une protéine ACE2 exprimée à un niveau élevé chez une créature est vraiment une preuve que l'animal peut être infecté. Il est concevable que ACE2 ne fonctionne pas de la même manière chez un chat que chez une personne.

Il y a eu à la fois des inquiétudes et un scepticisme considérable à propos des animaux de compagnie comme source de la maladie. David Grimm, de Science, a rapporté cette semaine que plusieurs laboratoires proposent des tests spécifiques pour l'animal pour le COVID-19 après la découverte du premier cas d'un chat atteint de la maladie. Grimm a précédemment interviewé Shelley Rankin, microbiologiste à l'École de médecine vétérinaire de l'Université de Pennsylvanie à Philadelphie, qui a mis en doute le partage de la maladie entre les humains et les animaux de compagnie. "Les chats et les chiens sont aussi des mammifères", a déclaré Rankin à Grimm. "Ils ont plusieurs des mêmes types de récepteurs sur leurs cellules que nous. Le virus pourrait donc théoriquement s'attacher à ces récepteurs. Mais va-t-il pénétrer dans leurs cellules et se répliquer? Probablement pas."

ZDNet suivi avec les chercheurs de l'article actuel, pour demander dans quelle mesure ils peuvent être certains que la transmission vers ou depuis les chats et les chiens peut se produire, étant donné que la protéine ACE2 pourrait fonctionner différemment selon les espèces.

"Bien qu'il existe un degré élevé de conservation de l'ACE2 chez les mammifères, pouvons-nous être certains que l'ACE2 fonctionne de la même manière qu'un récepteur pour COVID-19 chez tous les mammifères?" ZDNet ont demandé les auteurs. "Peut-être qu'il est responsable pour les humains mais pas pour les chats ou les chiens? (L'ACE2 pourrait ne pas se lier de la même manière chez d'autres mammifères, donc il pourrait ne pas faciliter l'entrée du virus?)."

Dans un courriel, l'auteur principal Kun Sun a répondu et a cité des travaux antérieurs qui montrent que l'ACE2 peut être la façon dont le SRAS-CoV-2 infecte "de nombreuses espèces", y compris un La nature papier début février. Sun a également cité un article de 2006 dans le Journal of Virology montrant que le virus du SRAS "utilise l'ACE2 pour infecter les chats et les furets", a décrit Sun.

Sun poursuit en écrivant: "Nous pensons que la haute conservation de l'ACE2 fournit la base moléculaire pour que le virus puisse infecter divers mammifères."

"Cependant, il est également possible que le SRAS-Cov-2 ait d'autres récepteurs chez des mammifères spécifiques, mais ACE2 pourrait certainement servir de récepteur fonctionnel dans la plupart des espèces", a ajouté Sun.

D'autres chercheurs chinois sont parvenus à des conclusions différentes. La natureMercredi, Smriti Mallapaty a rapporté que le Harbin Veterinary Research Institute en Chine avait délibérément infecté des animaux de laboratoire par le SRAS-CoV-2 et avait découvert que les chats pouvaient transmettre l'ARN viral à d'autres chats dans la même cage, mais seulement dans une mesure limitée, et aucun des chats n'a montré de symptômes de maladie. L'étude a révélé que les chiens sont «moins sensibles au virus».

Compte tenu de la disparité des perspectives entre les chercheurs et entre les tenues officielles telles que le CDC, une enquête plus approfondie est probablement nécessaire pour déterminer si un mécanisme fonctionne avec l'ACE2 chez les chats, les chiens et les autres mammifères de la même manière qu'il semble l'être chez les humains.